三维系统在制作效果上通常更加真实，因为它能够模拟现实世界中的光线、材质、阴影等因素，使得作品看起来更加逼真。通过三维系统，制作者可以更准确地控制每一个物体的外观和运动，从而打造出栩栩如生的场景和角色。相比之下，二维系统在表现真实感方面有一定局限性，因为它无法像三维系统那样精确地模拟物体在空间中的运动和互动。

另一个不同之处在于，三维系统在制作效果时通常需要更多的时间和资源。因为在三维系统中，制作者需要从零开始创建整个三维场景，包括建模、纹理、灯光、动画等方面的工作，这些工作需要费时费力。而二维系统则相对简单，制作者只需要在二维平面上进行绘制或动画制作，省去了很多复杂的步骤。因此，要达到同样的制作效果，通常情况下三维系统需要更多的投入。

此外，三维系统在制作效果时可以实现更加复杂和精细的视角和视觉效果。通过调整摄影机的位置和角度，制作者可以呈现出多样化的镜头效果，比如特写、透视、远景等，使得作品更加生动有趣。而二维系统由于受限于平面的特性，视角和视觉效果相对单一，难以表现出三维系统那样的立体感和变化多样的画面效果。

另外，三维系统在制作效果时可以实现更多样化的交互和动态效果。通过添加物理引擎和程序脚本，制作者可以实现物体的碰撞、运动轨迹、粒子效果等复杂的动态效果，使得作品更加生动活泼。而二维系统在这方面通常较为简单，制作者只能通过一些简单的动画制作技巧来表现物体的运动和互动，难以达到三维系统那样的高度自由度和复杂效果。

总的来说，三维系统和二维系统在制作效果上各有优势和局限性。三维系统可以实现更加真实、复杂、立体的画面效果，但需要更多的时间和资源投入；而二维系统则相对简单快捷，但在表现真实感、立体感和复杂交互方面有一定的局限性。制作者可以根据具体需求和项目要求选择合适的系统，以达到最佳的制作效果。